疫苗藥用塑料瓶的設計結構關系到疫苗包裝的存放保質期，疫苗瓶的瓶口直徑需滿足藥品可盛裝性加上取藥時的余地。其次是它瓶蓋的設計，瓶蓋的設計須按照瓶蓋的直徑尺寸配套瓶體，且能嚴實密封，須通過液體滲漏檢測。一般未經開封的疫苗瓶須用鋁蓋加密封。

疫苗藥用塑料瓶的結構設計需注意事項：瓶口直徑的設計主要考慮盛裝藥品加上適當空間，既要滿足機械裝藥的需要，也要考慮用藥時的方便。塑料瓶頸部處的螺紋形狀的橫截面多數呈半圓形，從外部看為兩頭細螺紋。也有呈梯形的螺紋，稱單頭螺紋。瓶口頸部螺紋形式的設計主要取決于要與瓶蓋具有較好的互配性，因為藥品包裝的阻濕性能很大程度上取決于瓶口與瓶蓋的配合經施加扭力后的緊密度，此處是反映瓶口密封性能是否合格的主要部位。

塑料疫苗瓶在裝藥后應采用可調節扭力大小的旋蓋機來旋蓋，扭力可按有關標準，視瓶蓋的直徑選定。瓶與蓋的尺寸配合是阻濕的重要前提，而旋蓋是否緊密則是阻濕效果優劣的關鍵。為確保藥品的安全性，首先要提高瓶口部位的密封性，增加阻濕效果。目前，藥用塑料瓶口均采用鋁箔墊片電磁感應封口，而瓶蓋多采用防盜蓋。這種防盜蓋可對密封破壞提供可見痕跡，其結構主要是瓶蓋周圍沿側裙底有小孔，以形成斷開線。當扭轉瓶蓋時，由于波形翻邊的棘爪緊鎖于瓶口下端的凸環下，反旋轉蓋即可沿斷開線與鎖圈斷裂，以此鑒別藥品包裝后是否已被打開過，用藥開啟與再蓋也較方便。

可看出疫苗藥用塑料瓶具有較高的密封性、安全性、阻濕性、防盜性等特點。 在醫療科技不斷發展的時代，藥用塑料瓶已成為疫苗藥用包裝的有力支撐。